Tid og sted for prøveforelesning
Se prøveforelesning.
Bedømmelseskomité
- Førsteopponent: Professor Maryann Martone, Department of Neuroscience, University of California, San Diego
- Andreopponent: Professor Francisco Clascá Cabré, Department of Anatomy & Graduate Program in Neuroscience, Autónoma de Madrid University
- Leder av komiteen: Professor Leif Gjerstad, Institutt for klinisk medisin, Universitetet i Oslo
Disputasleder
Professor Turid Birgitte Boye, Institutt for medisinske basalfag, Universitetet i Oslo
Hovedveileder
Professor Jan G. Bjålie, Institutt for medisinske basalfag, Universitetet i Oslo
Sammendrag
MR-basert atlas av rottehjernen for integrasjon av bildedata
Med økende levealder og en stadig eldre befolkning forventes det at hver tredje person vil kunne rammes av hjernesykdom i løpet av livet. En av de største utfordringene for å forstå hvordan hjernen fungerer under normale forhold og ved sykdom eller skade er knyttet til sammenstilling og analyse av informasjon om hjernen fra flere forskjellige kilder. Anatomisk lokalisering i hjernen er viktig for å kunne organisere og sammenligne innsamlede data. Eszter Agnes Papp og kolleger ved Universitetet i Oslo har etablert et anatomisk referanseatlas for rottehjernen og utviklet nye metoder for mer effektiv integrasjon og analyse av bildemateriale fra eksperimentelle studier.
I samarbeid med Duke University Medical Center har forskerne produsert høyoppløselige magnetresonansbilder for å skape et tredimensjonalt hjerneatlas. Basert på bildekontrast har de kartlagt grunnleggende anatomiske regioner og nervebaner gjennom hele rottehjernen. For å kunne navigere i atlaset har de introdusert et koordinatsystem i henhold til en internasjonal standard - Waxholm Space.
Forskerne har benyttet en samling av 2D og 3D hjernebilder for å identifisere anatomiske fellestrekk som er synlige i ulike typer bildedata fra rotte- og musehjernen, og derfor egner seg som landemerker for plassering av ny informasjon på riktig sted i atlaset. Videre har de utviklet analyseverktøy for automatisk deteksjon av regioner av interesse i mikroskopisk materiale og for registrering av bildene til atlaset.
Åpen tilgang til resultatene har gjort det mulig for andre forskere å bruke atlaset til å analysere bilder av både hjernestruktur og funksjon. Videre utvikling av atlaset er fokusert på å legge til mer detaljerte kart om flere hjerneområder, som for eksempel hippocampus og hørselssystemet.
For mer informasjon
Kontakt Gruppe for forskerutdanning.