Om prosjektet
Vi har funnet at proteinet ALFY (autophagy-linked FYVE protein) er viktig for degradering av proteinaggregater ved autofagi (Clausen et al, Autophagy 2010; Filimonenko et al, MolCell 2010). ALFY er ett av totalt åtte humane BEACH (Beige and Chediak Higashi)-proteiner, hvor alle (unntatt ett) er ekstremt store proteiner (300-430 kDa) med en felles C-terminal domenestruktur (PH-BEACH-WD40). BEACH-domenet er svært konservert og har blitt krystallisert fra to proteiner i familien. Vi fant at BEACH-domenet i ALFY er viktig for binding til p62, et ubiquitin-bindene protein involvert i autofag degradering av ulike intracellulære komponenter, som proteinaggregater, mitokondrier og bakterier. Man kjenner imidlertid ikke til noen andre interaksjonspartnere for BEACH-domenet, og funksjonen til de fleste proteinene i denne familien er også ukjent.
Vi vil benytte biokjemiske og bioinformatiske verktøy for å identifisere spesifikke bindingspartnere og forstå mer om strukturen og funksjonen til BEACH-proteinene. Videre vil vi studere betydningen av BEACH-proteinene i selektiv autofagi in vitro og in vivo. Vi vil benytte zebrafisk som modellorganisme, da zebrafisk har en nært beslektet homolog til alle humane BEACH-proteiner og mange ulike sykdomsmodeller er etablert. Mutasjoner i mange BEACH-proteiner er assosiert med sykdom, og økt kunnskap om deres interaksjonspartnere, lokalisering og cellulære funksjon er viktig for å identifisere nye terapeutiske mål i behandling autofagi- og BEACH-relaterte sykdommer.
Finansiering
Norges forskningsråd
Start-slutt
2013-2016