Prøveforelesning
Bedømmelseskomité
- 1. opponent: Project Manager EU Mike J. Taussig, Protein Technology Group, The Babraham Institute, Cambridge, England
- 2. opponent. Associate Professor Jochen M. Schwenk, Affinity Proteomics, Science for Life Laboratory, Solna, Sverige
- 3. medlem av bedømmelseskomiteen: Professor Inger Nina Farstad, Klinikk for diagnostikk og intervensjon, Institutt for klinisk medisin, Universitetet i Oslo
Leder av disputas
Førsteamanuensis Jon Anders Halvorsen, Klinikk for kreft, kirurgi og transplantasjon, Institutt for klinisk medisin, Universitetet i Oslo
Hovedveileder
Forsker Fridtjof Lund-Johansen, Immunologisk institutt, Oslo universitetssykehus HF, Rikshospitalet
Sammendrag
Hovedmålet med prosjektet var å utvikle en bedre metode for å analysere proteiner fra hudceller. Det er grunn til å tro at stor-skalamålinger av cellulære proteiner vil gi ny innsikt i sykdomsprosesser som i neste omgang vil gi grunnlag for ny og bedre behandling av hudsykdommer. I dag er stor-skala proteinanalyse, eller proteomikk, synonymt med massespektrometri. Denne metoden er svært dyr og tidkrevende, og den brukes i liten grad i forskning på hudsykdommer.
I dette prosjektet har vi utviklet en metode basert på bruk av antistoffer mot humane proteiner. Antistoffene bindes til latexpartikler med flere tusen forskjellige fargekoder. Partiklene brukes for å binde proteiner fra prøven, og målingene gjøres med et flow cytometer. Dette instrumentet leser fargekodene til partiklene og måler mengden protein som er bundet fra prøven. Tidligere forsøk på å utvikle liknende teknologi har strandet fordi det har vært vanskelig å oppnå spesifisitet når et stort antall antistoffer brukes samtidig. Selv om antistoffer er ment å være spesifikke for ett bestemt protein, kryss-reagerer de ofte med andre proteiner. Her har vi løst dette problemet ved å separere proteinene i prøven før man gjør målingene. Vi har utviklet forbedrete metoder for å separere proteiner i ulike deler av cellen. I tillegg har vi separert proteiner med ulik størrelse. Ved å kombinere nye og bedre metoder for proteinseparasjon med vår nye partikkelteknologi har vi oppnådd å måle mange hundre proteiner samtidig med høy spesifisitet. Målingene gir også informasjon om hvor proteinene befinner seg i cellene og om de forekommer alene eller i komplekser med andre proteiner. Metoden ble brukt for å gjøre stor-skala målinger av proteiner som styrer celledeling og til å studere endringer som skjer når hudceller utsettes for sollys.
Den nye teknologien gir helt nye muligheter for å studere sentrale biologiske prosesser i hudceller. Dette vil kunne gi grunnlag for ny og bedre behandling av hudsykdommer.
Kontaktperson
For mer informasjon, kontakt Kari-Anne Bjørnerud